Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms