Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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