Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms