Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms