Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

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Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rnf225Q9D7D1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rnf225Q9D7D1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rnf225Q9D7D1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rnf225Q9D7D1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rnf225Q9D7D1 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf225Q9D7D1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rnf225Q9D7D1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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