Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Q9D727 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Q9D727 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Q9D727 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Q9D727 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Q9D727 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q9D727 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9D727 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9D727 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9D727 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9D727 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9D727 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9D727 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9D727 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9D727 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q9D727 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q9D727 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms