Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb4aQ9D6F9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms