Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms