Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
4930564D02RikQ9D4S4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms