Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Phf6Q9D4J7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Phf6Q9D4J7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Phf6Q9D4J7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Phf6Q9D4J7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Phf6Q9D4J7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Phf6Q9D4J7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Phf6Q9D4J7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Phf6Q9D4J7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf6Q9D4J7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Phf6Q9D4J7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Phf6Q9D4J7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Phf6Q9D4J7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf6Q9D4J7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms