Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms