Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cfap53Q9D439 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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