Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx29Q9D3S3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms