Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Obox1Q9D350 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms