Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krt20Q9D312 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krt20Q9D312 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krt20Q9D312 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krt20Q9D312 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krt20Q9D312 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Krt20Q9D312 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Krt20Q9D312 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Krt20Q9D312 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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