Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx20Q9D2Y5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx20Q9D2Y5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms