Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmed11Q9D2R4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms