Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Trappc6bQ9D289 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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