Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shmt2Q9CZN7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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