Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc77Q9CZH8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc77Q9CZH8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc77Q9CZH8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc77Q9CZH8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc77Q9CZH8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc77Q9CZH8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc77Q9CZH8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc77Q9CZH8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc77Q9CZH8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc77Q9CZH8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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