Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snf8Q9CZ28 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms