Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms