Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Xrcc3Q9CXE6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Xrcc3Q9CXE6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Xrcc3Q9CXE6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Xrcc3Q9CXE6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Xrcc3Q9CXE6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Xrcc3Q9CXE6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Xrcc3Q9CXE6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Xrcc3Q9CXE6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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