Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Wdr55Q9CX97 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Wdr55Q9CX97 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms