Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx47Q9CWX9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ddx47Q9CWX9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ddx47Q9CWX9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ddx47Q9CWX9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ddx47Q9CWX9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ddx47Q9CWX9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ddx47Q9CWX9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ddx47Q9CWX9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ddx47Q9CWX9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx47Q9CWX9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ddx47Q9CWX9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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