Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Khdc3Q9CWU5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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