Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn3Q9CVD2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn3Q9CVD2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms