Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQM1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQM1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQM1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQM1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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