Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd2aQ9CQJ1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms