Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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