Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Q9CQC3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CQC3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Q9CQC3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Q9CQC3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Q9CQC3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Q9CQC3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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