Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med4Q9CQA5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms