Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ85

Timm22, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm22Q9CQ85 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm22Q9CQ85 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms