Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp2Q9CQ73 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms