Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms