Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Use1Q9CQ56 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms