Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms