Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms