Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms