Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smim3Q99PE5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smim3Q99PE5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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