Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf2ird2Q99NI3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms