Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brms1Q99N20 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Brms1Q99N20 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Brms1Q99N20 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Brms1Q99N20 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brms1Q99N20 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms