Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd1Q99MV1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms