Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms