Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab28Q99KL7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rab28Q99KL7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rab28Q99KL7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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