Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TrabdQ99JY4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TrabdQ99JY4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TrabdQ99JY4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TrabdQ99JY4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TrabdQ99JY4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TrabdQ99JY4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TrabdQ99JY4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrabdQ99JY4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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TrabdQ99JY4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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