Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms