Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms