Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
SptssbQ925E8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms