Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Med28Q920D3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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